武昌起义胜利，章太炎提出了“革命军起，革命党消”④的错误口号，主张解散同盟会，并和一些立宪党人在一起，组织中华民国联合会。1912年1月1日，孙中山在南京就任临时大总统，聘任章太炎为总统府枢密顾问，他不愿常驻南京，返回上海。2月中旬，在讨论建都问题时，章太炎主张建都北京，认为“中国本因旧之国，非新辟之国，其良法美俗，应保存者则存留之，不能事事更张也”⑤。他依恋旧制度，说“专制非无良规，共和非无粃政”，“政治法律，皆依习惯而成”①，主张中央“特建都察院”，“限制元首”，地方“废省存道”，而对代议民主制则表示反对，主张“限制财产”，又以“夺富者之田以与贫民”为“大悖乎理”②。 　　南北和议告成，袁世凯上台，章太炎幻想袁世凯“厉精法治”，“以厝中夏于泰山磐石之安”③。在用人问题上，以为“同盟会人材乏绝，清流不归”④。反对“政党内阁”，提出“取清时南方督抚有材名者以充阁员之选”⑤。说什么：“汉之良相，即亡秦之退官；唐之名臣，即败隋之故吏。”主张“循旧贯”，用“老吏”⑥。将中华民国联合会与一些小政团合并，改组为统一党，以后更与民社等并为共和党，推黎元洪为理事长。 　　袁世凯给了章太炎一个总统府高等顾问的空衔，不久又委任为东三省筹边使，调出北京。章太炎兴致勃勃地跑到东北去“兴办实业”，设东三省筹边使署于长春，拟《东三省实业计划书》，提出“设立三省银行，以圆易吊，使民易知”，并铸造金币。“欲铸金币，又不可不预浚金源，非开办金矿，收买金砂，不足以供鼓铸。又请开浚松花江、辽河，去其淤梗，以利交通”。还拟“组织报馆”，“设会研究”⑦。但没有多久，宋教仁被刺，血的教训使他猛醒过来，他沉痛地《挽宋教仁》：“愿君化彗孛；为我扫幽燕”，对袁世凯不信任了。4月，“托事南行”。次月，赴武昌，谒黎元洪，在鄂致电袁世凯，请去梁士诒、陈宦、段芝贵、赵秉钧“四凶”①。接着，由武汉到了北京，袁世凯设法笼络。5月25日发令“章炳麟授以勋二位”②，“冀以歆动”。6月4日，离京来沪。而他早先提议在东北筹设实业银行的借款，财政部长梁士诒不肯盖章，章太炎“实业计划”落空，感到“大抵政府之与我辈，忌疾甚深，骂亦阻挠，不骂亦阻挠”，于是决计“辞差”，“奉身而退”。③④章太炎：《致留日满洲学生书》，《章太炎政论选集》，第519—520页。⑤《章太炎之消弭党见》，天津《大公报》1911年12月12日。 　　①章太炎：《中华民国联合会第一次大会演说辞》，《章太炎政论选集》，第532页。②章太炎：《大共和日报发刊辞》，《章太炎政论选集》，第537页。 　　③章太炎：《中华民国联合会第一次大会演说辞》，《章太炎政论选集》，第533页。④章太炎：《致袁世凯论治术书》，《章太炎政论选集》，第584页。 　　⑤章太炎：《上大总统书》，《章太炎政论选集》，第612页。 　　⑥《民立报》1912年6月25日。 　　⑦章太炎：《内阁进退论》，《章太炎政论选集》，第606页。 　　①《大共和日报》1913年2月1日。 　　②《民立报》1913年5月14日。 　　③《民立报》1913年5月27日。 　　1913年7月，孙中山、黄兴举兵武力讨袁，章太炎却不信赖，说什么“讨袁者亦非其人”④。他既骂袁世凯“用心阴挚，正与西太后大同”，又说孙中山“与项城一丘之貉”⑤。“谓宜双退袁与孙、黄，改建贤哲，仆则承命”⑥。以为“若为久远计，凡一政党，非有实业为中坚，即有侠士为后应，无此即不足以自树。非实业则费用不给，而政府得以利用之矣；非侠士则气势不壮，而政府得以威喝之矣”⑦。以为总统改选，“大抵仍宜推举黄陂，必不肯任，然后求之西林”。“黄陂之廉让，可望责任内阁；西林之果毅，可望廓清贪邪”①。黎元洪（黄陂）也好，岑春煊（西林）也好，都是清朝旧官僚，民国新军阀，章太炎对这些人寄以厚望，他已彷徨歧途了。 　　8月，章太炎“冒危入京师”，一方面看到“京邑崎岖，道路以目”，以为“吾虽微末，以一身撄暴人之刃，使天下皆晓然于彼之凶戾，亦何惜此孱形为”②，表示不畏强暴，敢临虎穴；另一方面又以为“共和党势渐扩张，此为可熹”③，“连日议员入党者，已增三十人矣，骥老伏枥，志在千里，况吾犹未老耶？”④但是，袁世凯对章太炎还是不肯放松，对他加紧迫害，把他软禁起来，梁士诒、赵秉钧等还欲“捏造证据，置章于死”⑤。 　　1914年1月，章太炎欲乘车离京，为军警所阻。7日，“以大勋章作扇坠，临总统府之门，大诟袁世凯之包藏祸心”，仍被监禁。曾决意绝食，“以死争之”，自云：“不死于清廷购捕之时，而死于民国告成之后，吾何言哉！”⑥直到1916年袁世凯死后，才被释放。在监禁期间，编成《章氏丛书》初编。④章太炎：《致伯中书四》，《章太炎政论选集》，第655页。 　　⑤章太炎：《致伯中书九》，《章太炎政论选集》，第666页。 　　⑥章太炎：《致伯中书八》，《章太炎政论选集》，第661页。 　　⑦章太炎：《致伯中书九》，《章太炎政论选集》，第666页。 　　①章太炎：《致伯中书十四》，《章太炎政论选集》，第677页。 　　②章太炎：《致伯中书八》，《章太炎政论选集》，第661页。 　　③章太炎：《致伯中书十三》，《章太炎政论选集》，第675页。 　　④章太炎：1913年8月17日《家书》。 　　⑤章太炎：1913年8月26日《家书》。 　　⑥《民立报》1913年8月23日。